Partenariat entre l'Institut Curie (Carnot Curie Cancer) et Google utilisant l'IA pour l'analyse de données transcriptomiques et épigénétiques complexes

12 2020
Les Carnot et les entreprises

L'Institut Curie (Carnot Curie Cancer) et Google lancent un programme de recherche conjoint sur l'intelligence artificielle (IA) afin de développer et mettre en œuvre des méthodes de deep learning (DL) pour l'analyse de données transcriptomiques et épigénétiques complexes en cellule unique (« single-cell »). Obtenues à partir de lignées cellulaires et d’échantillons de tissus provenant de souris, ces séries de données seront utilisées pour développer de nouveaux algorithmes de deep learning. À long terme, ce projet de recherche pourrait aider à caractériser l'hétérogénéité des tumeurs et à prédire la résistance au traitement. 

Dans le cadre de ce partenariat, l'Institut Curie et Google combineront leur expertise en cellule unique et en deep learning afin de développer des approches novatrices à la frontière entre la science des données et la biologie. Plus spécifiquement, l'expertise de Céline Vallot et de son équipe permettra de générer des données scChIP-seq1 obtenues à partir de lignées cellulaires et d'échantillons de tissus provenant de souris. Ces précieuses séries de données seront analysées et utilisées par l'équipe de Google pour développer de nouveaux algorithmes de deep learning en collaboration avec l'équipe de Céline Vallot. L'objectif de cette collaboration ? L'utilisation d'approches de deep learning pour étudier les données épigénomiques et transcriptomiques en cellule unique dans le cancer, afin de caractériser l'hétérogénéité des tumeurs et, à terme, de prédire la résistance au traitement. Ce projet vise à approfondir la structure des algorithmes de deep learning pour extraire des informations et interpréter ces composantes au niveau biologique. 

Amaury Martin, directeur Valorisation et Partenariats Industriels & directeur de l'institut Carnot Curie Cancer affirme : "L'Institut Curie est très heureux d'êre le premier centre de recherche sélectionné par Google Research pour un partenariat de cette nature. Il renforce notre engagement à jouer un rôle majeur dans le développement des approches d'intelligence artificielle appliquées aux sciences de la vie."